Progenesis QI (PQI) is a multiplatform bioinformatics tool that facilitates the identification workflow for metabolomics experiments. PQI uses fragmentation data provided by MassBank of North America (MoNA) libraries, among others, for metabolite annotation. However, PQI does not officially support MoNA libraries and other libraries based on structure-data files (.sdf). This paper describes the development and application of a software named MoNA to Progenesis QI Library Converter, allowing PQI and MoNA by correcting the fragmentation data of the library for Progenesis readability. We evaluated several public experimental datasets, including human plasma, plant extracts, cultured cells, bacteria, rat serum, and rat hippocampus. The results showed that it is mandatory to proceed with file conversion of each library to allow PQI to access fragmentation information from .msp (main spectra profile) files. This step is highly recommended to improve the identification level of the metabolites.

RESUMO Objetivou-se com este estudo avaliar o efeito da irrigação com efluente salino da piscicultura aplicado em diferentes fases fenológicas sobre a produção de frutos e o vigor de sementes de tomateiro cereja. O experimento foi conduzido em casa de vegetação, em Mossoró, RN, utilizando-se delineamento inteiramente casualizado, com 10 tratamentos, que consistiram do uso do efluente da piscicultura de condutividade elétrica (CE) de 4,54 dS m-1 e água de abastecimento com CE de 0,54 dS m-1, intercalados durante quatro fases fenológicas (crescimento de 1 a 19 dias após transplantio (DAT), florescimento de 20 a 31 DAT, enchimento do fruto de 32 a 60 DAT e amadurecimento de 61 a 89 DAT). A aplicação do efluente salino da piscicultura durante toda uma fase fenológica do tomateiro cereja não reduz a produção de frutos por cacho, mas reduz a produção de sementes e o vigor das sementes produzidas. O uso do efluente salino da piscicultura nas fases inicial e de maturação, e o uso do efluente com duas aplicações sucessivas, intercaladas com uma irrigação com água de baixa salinidade, são favoráveis para a produção de sementes de tomateiro cereja com vigor satisfatório. A aplicação intercalada do efluente salino da piscicultura, com duas posteriores irrigações sucessivas com água de baixa salinidade, apesar de reduzir a produção de sementes, favorece a produção de sementes de alto vigor. O uso do efluente salino da piscicultura nas fases de floração e frutificação reduz a produção de sementes e o vigor das sementes produzidas.

HIGHLIGHTS Irrigation with saline effluent from fish farming does not reduce cherry tomato fruit production. The use of saline effluent from fish farming in irrigation reduces production and vigor of cherry tomato seeds. Application of effluent in the appropriate stages promotes production of fruits and seeds of cherry tomato equal to those of the control.

This work describes the development of an automatic titrometric method in flow-batch with potentiometric detection using alternative and easily accessible materials. Arduino board and its modules, solenoid valves to control the flow rate, peristaltic pump to propel and suction fluids and tubes of inert material to connect the different parts of the Flow-Batch Analyser (FBA) were used. The use of solenoid valves controlled by microcontrollers proved to be efficient for controlling the flow in FBA systems, the correlations of their flow rates as a function of time showed good linearity with correlation coefficients (r) 0.9994 and 0.9997 for the valve 1 and valve 2, respectively, allowing correct addition of pre-established volumes. Accuracy was verified by comparing the results of the proposed method with the classic potentiometric titration with statistically evaluated by Student’s t-test in NaOH with HCl and vinegar with NaOH titrations. Results confirmed the efficiency to use Arduino board and its modules and automatic titrometric method in flow-batch developed in this work allow the implementation of practical disciplines, such as potentiometric titration and flow analysis system in undergraduate courses, making these instruments more accessible, especially for the chemistry students.

OBJETIVO: Comparar experimentalmente, em cães, três técnicas de esofagogastrofundoplicatura - anterior, posterior e lateral - após cardiomiotomia ampla. MÉTODO: Os animais foram separados aleatoriamente em quatro grupos: Grupo A: Válvula anti-refluxo anterior (n=5); Grupo P: válvula anti-refluxo posterior (n=5); Grupo L: Válvula anti-refluxo lateral (n=5); Grupo C: Grupo controle, no qual não foi realizado nenhum tipo de fundoplicatura após a cardiomiotomia (n=10). A avaliação pré-operatória foi realizada através de endoscopia, biópsia da mucosa gastroesofágica, pHmetria e manometria esofágica. Após cinco semanas, realizou-se reavaliação, baseada em dados endoscópicos, pHmétricos, manométricos e histopatológicos. Os animais foram mortos e os segmentos esofagogástricos retirados para exame histopatológico RESULTADOS: Ao exame histopatológico detectou-se esofagite em todos os casos do grupo controle e em nove casos dos grupos com válvulas, e nestes, quando presente, a esofagite foi de menor extensão e de grau menos avançado do que no grupo controle. Através da manometria pré e pós-operatória, observou-se que: 1) o grupo controle apresentou uma redução na pressão na ZAP de 39,2mmHg para 23,4mmHg; 2) os grupos A, P, e L apresentaram uma variação da ZAP de 39,7, 39,9 e 39,7mmHg para 40,9, 44,8 e 41,3mmHg, respectivamente. CONCLUSÕES: 1) A cardiomiotomia ampla provoca refluxo gastroesofágico e conseqüente esofagite; 2) As três válvulas anti-refluxo estudadas restauram o segmento de alta pressão e diminuem a incidência de refluxo e de esofagite.

OBJECTIVE: To compare three techniques of esophagogastrofundoplication - anterior, posterior and lateral-post cardiomyotomy, in dogs. METHOD: Pre-operative assessment included esophagoscopy plus biopsy of the mucosa, pH determination and manometry. The animals were divided into four groups: Group A: anterior anti-reflux valve (n=5); group P: posterior valve (n=5); Group L: lateral valve (n=5); Group C: control group, no fundoplication (n=10). After five weeks, the animals were submitted to endoscopy plus biopsy, pHmetric and manometric examinations and histopathological analysis. RESULTS: Histophatological examination detected esophagitis in every case of the control group and in nine cases of the groups with fundoplication. When present, esophagitis was milder in the valve groups than in the control group. The average value of the pressure in high pressure zone (HPZ) detected by manometric examination in the control group, was significantly reduced after cardiomyotomy (39,2 to 23.4mmHg). In the groups with fundoplication, there was no significant difference between preoperative and postoperative mean values of the HPZ pressure. The values detected preoperatively in groups A, P and L were 39.7, 39.9, and 39.7mmHg respectively and 40.9, 44.8 and 41.3 mmHg postoperatively. CONCLUSIONS: 1) cardiomyotomy causes gastroesophageal reflux and esophagitis; 2) any type of fundoplication valve, added to the myotomy, restores the lenght and the pressure of the HPZ=ZAP and reduces the incidence of reflux and esophagitis.